SyBIT – Systems Biology IT

SyBIT - das IT und Bioinformatikprojekt von SystemsX.ch

Im Rahmen der schweizerischen Systembiologieinitiative SystemsX.ch hilft das Projekt SyBIT den Forschungsprojekten als zentraler Dienstleister bei der Bewältigung der digitalen Datenflut. Denn für deren Bewältigung stehen nicht immer passende Lösungen bereit.

Meist sind Wissenschaftler gezwungen, eigene Auswertungsprogramme zur Datenanalyse zu schreiben, Daten selbst zu verwalten und Speichermedien zu bewirtschaften. Dabei besteht das Risiko, dass Daten nach dem Weggang einer Person schlicht verloren gehen. Auswertungsprogramme wiederum werden zur «black box», weil ihre genaue Funktionsweise nicht mehr bekannt ist, was unwissentlich zu Fehlern führen kann.

Aufgaben und Zusammensetzung von SyBIT

An dieser Stelle setzt das Projekt SyBIT mit seinen vielschichtigen Aufgaben an. Das Team:

  • hilft den Forschungsgruppen, die nötige Daten- und Recheninfrastruktur bereitzustellen sowie - wenn möglich - automatische Abläufe zu planen;
  • stellt standardisierte Software und Datenverwaltungs-Dienste zur Verfügung;
  • übernimmt selbstentwickelte Programme und schreibt diese bei Bedarf um oder verpackt sie in wiederverwendbare Bibliotheken;
  • hilft Forschungsgruppen ihre Algorithmen der breiten Wissenschaftsgemeinde in einer Form zur Verfügung zu stellen, in der sie leicht handhabbar sind;
  • verwaltet die Wiki Plattform, E-Mail Listen und weitere von der Gemeinschaft verwendete Web-basierte Dienste;
  • bietet, zusammen mit den Partnerinstituten, Kurse zur Nutzung der verschiedenen Software und Dienstleistungen an.
Projektleitung Bernd Rinn
Anzahl beteiligte Partner (lokale Supportorganisationen, zentrale Einrichtungen, Forschungsgruppen) 6
Projektdauer Jan. 2009 - Dez. 2015
Durch SystemsX.ch bewilligte Mittel CHF 14.750 Millionen

Stand: September 2015 

Kontakt

Dr. Bernd Rinn
Projektmanager SyBIT
ETH Zürich
ID Scientific IT Services
Weinbergstrasse 11
CH - 8092 Zürich 
Tel. +41 44 632 06 08
brinn(at)ethz.ch

SyBIT Website
SyBIT Wiki
SyBIT Publikationen

Artikel zu SyBIT im X-Letter 21
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Artikel zu SyBIT im X-Letter 30
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